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1.先天性大脑发育畸形。如无脑回畸形，巨脑回畸形，多小脑回畸形，灰质异位症，脑穿通畸形，先天性脑积水，肼胝体发育不全，蛛网膜囊肿，头小畸形，巨脑症等。

2.神经皮肤综合症。很常见的有结节性硬化，神经纤维瘤病和脑三叉血管瘤病等。

3.遗传代谢病。如苯丙酮尿症、高氨血症、脑脂质沉积症、维生素B6依赖症等均可引发小儿癫痫发作。

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